Vamos por partes:
A Lima é loja de shopping, tem bons kits e normalmente um suprimento bom de produtos para modelismo. Mas é preço de loja de shopping e alguns produtos deles são mais baratos pelo site (confira antes de ir).
Já a passatempo e a Arte Modelismo são as tradicionais lojas de bairro, onde além de comprar é possível bater um bom papo com os donos. Na passatempo faz algum tempo que não passo por lá, então não sei te dizer como está atualmente. Quando fui pela última vez fui muito bem atendido.
Já na arte modelismo vou sempre. É a loja do seu Ariel (já falecido e com o qual aprendi muita coisa). Hoje é a filha quem cuida. Tem muitos kits, alguns antigos, difíceis de achar, além de suprimentos também. Os preços são justos, além de ter aquele clima de loja de bairro, onde você entra e fica olhando as prateleiras tranquilamente, o endereço desta é R. Samuel Cezar, 1235 - Água Verde.
Que eu conheça são estas três que trabalham com plastimodelismo, outras realmente não conheço (somente algumas que são lojas de outros hobbies, como aeromodelismo e que as vezes tem um ou outro kit).
Espero que ajude.