Edu, nessas áreas indicadas para não se usar cola, visando manter a funcionalidade da(s) peça(s) envolvidas, não deixa nada de cola por perto, nem mesmo branca. É um exemplo clássico da Lei de Murphy. Se alguma coisa pode dar errado, seguramente vai dar...
Na peça A46, tens na parte de cima e na parte de baixo, duas pequenas reentrâncias, ou seja, quatro pequenos pontos de apoio para os pequenos apoios existentes na parte interna da peça A40. Encaixados, cuidadosamente, vão propiciar a movimentação da escotilha lateral da torre.
Pessoalmente, em situações como essa, com peças delicadas ou frágeis em montagem, eu colaria bem ajustada a escotilha lateral à torre, com dois pontinhos de cola branca ou uma passada leve de verniz, possibilitando pintar interna e externamente, sem maiores problemas. No final da montagem, antes de fechar a torre, por exemplo, ajusta a peça A46 com a peça A40 e a deixa na posição desejada.
Na situação atual, eu cortaria com uma serra bem fina, ao longo da parte onde está o pino colado (1), lixava, deixando tudo liso e traria a parte 2, com a escotilha para fora ou para dentro, colando em seguida o conjunto.
Parece-me a parte mais fácil.
Não esquece os parafusos da parte que vai presa a parede da torre. Estão na árvore, entre as peças A1 e A2.
Esses kits com interior nos obrigam a estudar bem antecipadamente as etapas para não sermos pegos de surpresa por essas situações. Acho que consegues resolver a situação com algum trabalho, mas tem tudo para ficar bem.
Com relação a cola Tek Bond 200, cuidado, pois ela tem uma viscosidade muito alta, ou seja, vai escorrer praticamente nada. Assiste esse vídeo abaixo
https://www.youtube.com/watch?v=o1OfdvhhWHY&t=16s
e terás uma abordagem muito boa sobre essa cola. Eu, pessoalmente, uso a 793 e 200.
Espero ter ajudado. Abs.